Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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