Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Pramef6A2A8M8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.8 ms