Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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