Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Col4a3Q9QZS0 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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Col4a3Q9QZS0 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col4a3Q9QZS0 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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