Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms