Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms