Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FancaQ9JL70 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FancaQ9JL70 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms