Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms