Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Kcnn1Q9EQR3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Kcnn1Q9EQR3 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Kcnn1Q9EQR3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Kcnn1Q9EQR3 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Kcnn1Q9EQR3 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Snx7-205ENSMUST00000198499 1314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Kcnn1Q9EQR3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Kcnn1Q9EQR3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Kcnn1Q9EQR3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Kcnn1Q9EQR3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Kcnn1Q9EQR3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Kcnn1Q9EQR3 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnn1Q9EQR3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms