Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms