Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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Alkbh4Q9D8F1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Alkbh4Q9D8F1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Alkbh4Q9D8F1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Alkbh4Q9D8F1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Alkbh4Q9D8F1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Alkbh4Q9D8F1 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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Alkbh4Q9D8F1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Alkbh4Q9D8F1 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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