Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms