Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Exo5Q9CXP9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 347 ms