Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms