Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Use1Q9CQ56 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Use1Q9CQ56 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Use1Q9CQ56 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Use1Q9CQ56 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Use1Q9CQ56 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Use1Q9CQ56 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Use1Q9CQ56 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Use1Q9CQ56 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Use1Q9CQ56 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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