Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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