Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms