Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Dnajc28Q8VCE1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Dnajc28Q8VCE1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Dnajc28Q8VCE1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Dnajc28Q8VCE1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Dnajc28Q8VCE1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Dnajc28Q8VCE1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Dnajc28Q8VCE1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dnajc28Q8VCE1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms