Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Vrk3Q8K3G5 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vrk3Q8K3G5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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