Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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