Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms