Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c1Q8K193 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms