Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms