Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms