Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rsph6aQ8CDR2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rsph6aQ8CDR2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rsph6aQ8CDR2 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rsph6aQ8CDR2 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rsph6aQ8CDR2 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rsph6aQ8CDR2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rsph6aQ8CDR2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rsph6aQ8CDR2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rsph6aQ8CDR2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rsph6aQ8CDR2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph6aQ8CDR2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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