Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms