Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4D8

Gm11541, Predicted gene 11541, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11541Q8C4D8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm11541Q8C4D8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm11541Q8C4D8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11541Q8C4D8 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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