Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms