Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf7ipQ7TT18 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms