Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tmed3Q78IS1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tmed3Q78IS1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms