Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms