Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms