Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms