Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Rnft1-201ENSMUST00000020827 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms