Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm28047Q3US59 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm28047Q3US59 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm28047Q3US59 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm28047Q3US59 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm28047Q3US59 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Gm28047Q3US59 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm28047Q3US59 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm28047Q3US59 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm28047Q3US59 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm28047Q3US59 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm28047Q3US59 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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