Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms