Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rnf149Q3U2C5 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rnf149Q3U2C5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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