Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VgfQ0VGU4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms