Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms