Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MestQ07646 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MestQ07646 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
MestQ07646 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms