Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VcpQ01853 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms