Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms