Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms