Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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