Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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