Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr4P70658 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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