Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms