Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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