Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms