Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PtgfrP43117 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PtgfrP43117 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PtgfrP43117 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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PtgfrP43117 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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PtgfrP43117 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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PtgfrP43117 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms